Компьютерлік химия-бұл химия мен компьютерлік технологиялардың түйіскен жерінде пайда болған, графиктер теориясын іргелі және қолданбалы сипаттағы химиялық мәселелерге қолдануға негізделген химияның салыстырмалы түрде жас саласы. Химияның заттар туралы ғылым және олардың бір — біріне айналуы туралы жалпы анықтамасына сүйене отырып, заттар (молекулалар) компьютерлік химияда молекулалық графиктермен, ал заттардың түрленуі (химиялық реакциялар) графиктермен формальды операциялармен модельденеді деп айтуға болады. Мұндай формальды-логикалық тәсіл кейбір жағдайларда химиялық есептерді алгоритмдеуді едәуір жеңілдетеді, оларды комбинаторика мен дискретті математиканың типтік есептеріне дейін азайтады және компьютерлік бағдарламалардың көмегімен шешімдер іздеуге мүмкіндік береді. Сол себепті, қазіргі таңда химик студенттерді химиялық қосылыстардың формулаларын жазу, оларды редакциялау, негізгі физика-химиялық қасиеттерін компьютерлік модельдеу үшін бағдарламаларды қолдану негіздерімен таныстыру арқылы студенттер затты модельдеу процесінде қоршаған әлем белгілі бір құрылымға ие және өзара түрлендіруге қабілетті заттардан тұрады деген идеяны дамыта отырып, пәндік химиялық сауаттылықты қалыптастырады. Химиялық ойлау, қоршаған әлем құбылыстарын химиялық тұрғыдан талдай білу, химиялық тілде сөйлеу және ойлау қабілеті де қалыптасады. Бұл мақала зат құрамын зерттеуде жалпыға қолжетімді Avogadro, ArgusLab бағдарламалары бойынша білім алушыларды таныстыруға бағытталған.
Avogadro, ArgusLab, IQmol, model, algorithm